علاوه بر 20 اسید آمینه ای که در ساختمان پروتئین ها نقش دارند، تعداد زیادی اسید آمینه نیز وجود دارند که نام مهمترین های آنها را ذکر می کنم:
4-هیدروکسی پرولین: مشتقی از پرولین است. نقش در دیواره ی سلولی گیاهان و کلاژن؛
6-N-متیل لایزین: جزئی از میوزین؛
5-هیدروکسی لایزین: مشتقی از لایزین است. نقش در کلاژن؛
دسموزین: مشتقی از 4 ریشه ی لایزین است. نقش در پروتئین فیبری الاستین؛
اورنیتین: پیش ساز سیترولین؛
سیترولین: پیش ساز آرژنین؛
گاما-کربوکسی گلوتامات: تروموبین؛
(پروتئین هایی که در انجام واکنش های متابولیک به Ca+2 متصل می شوند.)
سلنو سیستئین: به جای سولفور سیستئین، سلنیوم دارد. توجه: مشتقی از سرین محسوب می شود.